男性感染HPV可以通过肉眼观察、分子生物学技术以及组织病理学检查等三种方式进行检查。
1、肉眼观察男性感染HPV，最常见的表现是生殖器的尖锐湿疣，典型的皮损是上皮乳头瘤状、菜花样、颗粒状，或者鸡冠状的表现。用冰醋酸滴在病损上可以发白，这是典型的表现。
2、分子生物学的技术是通过棉签或者棉棒，蘸取疣体表面、冠状沟的分泌物，以及尿道口、探入尿道当中蘸分泌物来进行检测。应用PCR或者核酸分子杂交的技术，来看是哪一种类型的HPV，HPV也分为高危型和低危型两大类。
3、组织病理学检查需要取一点样本，然后进行病理切片。HPV感染形成的病损，需要和阴茎的珍珠疹、皮脂腺的异位、扁平湿疣、假性湿疣等相鉴别。
